====== Matlab ======

Jednoduché příklady na spuštění Matlab úloh najdete v adresáři /home/SOFT/modules/examples/Matlab/, který můžete zkopírovat do svého adresáře:
  cp -r /home/SOFT/modules/examples/Matlab/ ./
v adresáři //single// jsou dva soubory, matlabovský skript "montecarlo_single.m" a skript pro //sbatch// "slurm.sh". Zadáním
  cd single
  sbatch slurm.sh
se ve frontovém systému spustí na jednom jádře program, jehož běh trvá cca 20-40s (na této úloze jsou rychlejší stroje kraken-m1,...-m6).

V adresáři "parallel" je podobný příklad pro úlohu paralelizovanou přes 8 jader v rámci jednoho uzlu. Skript pro sbatch je:

  #!/bin/bash
  #SBATCH -J example_matlab
  #SBATCH -N 1
  #SBATCH -n 8
  #SBATCH --time=2:00
  #SBATCH -o slurm.%N.%J.%u.out # STDOUT
  #SBATCH -e slurm.%N.%J.%u.err # STDERR
  matlab -nodisplay -r "montecarlo_parallel;quit;"
  
Spuštění Matlab úlohy přes více uzlů není možné, protože není zakoupen "Matlab Parallel Server". Ve spouštěcím skriptu je proto vždy nutné zachovat volbu
  #SBATCH -N 1
\\
\\
=== Paralelní úloha: parpool ===
Paralelní metody v programech Matlabu jsou inicializovány funkcí "parpool". Program využívající 8 jader musí v našem nastavení obsahovat
  parpool('local', 8);
Lze ale doporučit automatické načtení počtu Slurmem alokovaných jader. Slurm totiž hodnotu definovanou "#SBATCH -n" ukládá do systémové proměnné "SLURM_NTASKS", kterou Matlab umí načíst
  sz = str2num(getenv('SLURM_NTASKS'));
  parpool('local',sz);