[[computing:jine_servery:start|{{:up1.png?direct|}}]]
[[computing:jine_servery:start|Cluster Termiti]]

[[:computing:jine_servery:|{{ :computing:jine_servery:software:soft1.png?nolink&100|}}]]
====== Software na clusteru ======
\\
===== Operační systém =====
Pro cluster byl zvolen operační systém **[[http://www.scientificlinux.org/|Scientific Linux]]** ve verzi **6.0**.

Tato verze linuxu je odvozena z [[http://www.redhat.com|RedHat Enterprise Linuxu]], kterou již dlouhou dobu v ÚT používáme, je vyvíjena v laboratořích CERNu a Fermiho laboratořích  a je přímo určena pro vědecké výpočty.
Výhodou distribuce je, že je naprosto bezplatná.

Na nodech je standardní konfigurace, s výjimkou síťové konfigurace. Ta musela být lehce upravena pro použití
infinibandu.
\\
\\
===== Aplikační software =====
==== Programy: ====

^ **ANSYS**  ^^ 
|//Verze://   | 15.0.7 |
|//Licence:// | akademická - [[http://shelob.it.cas.cz/ansys/|online stav licencí]]; login: ansys; heslo: 1dohens |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://  | [[http://www.ansys.com|domovská stránka]] |
| | |
| | |
^ **ANSYS**  ^^ 
|//Verze://   | 17.2 |
|//Licence:// | akademická - [[http://shelob.it.cas.cz/ansys/|online stav licencí]]; login: ansys; heslo: 1dohens |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://  | [[http://www.ansys.com|domovská stránka]] |
| | |
| | |
^ **Matlab**  ^^ 
|//Verze://   | R2014b (8.4.0.150421 64bit) |
|//Licence:// | akademická - [[http://shelob/matlab/|online stav licencí]]; login: matlab; heslo: 1dohens |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://  | [[http://www.mathworks.com/products/matlab/|domovská stránka]] |
| | |
| | |
^ **OpenFOAM**  ^^
|//Verze:// | 2.3.0  |
|//Licence:// | GNU Lesser General Public License v3   |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://| [[http://www.openfoam.com/|domovská stránka]]  |
|//Popis:// | OpenFOAM is a free, open source CFD software package.   |
| | |
| | |
^**ParaView**  ^^
|//Verze:// |4.2   |
|//Licence:// |Creative Commons  |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://|[[http://www.paraview.org//|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |ParaView is an open-source, multi-platform data analysis and visualization application.   |
| | |
| | |
^**Blopex - Block Locally Optimal Preconditioned Eigenvalue Xolvers **  ^^
|//Verze:// | |
|//Licence:// |GNU Lesser General Public License v3 |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy:// |[[http://code.google.com/p/blopex/|domovská stránka]] |
| | |
| | |
^**DL_POLY**  ^^
|//Verze:// |4.05.1  |
|//Licence:// |academic licence  |
|//Odpovědná osoba:// | |
|//Odkazy://|[[http://www.stfc.ac.uk/SCD/research/app/ccg/software/DL_POLY/44516.aspx|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |DL_POLY is a general purpose serial and parallel molecular dynamics simulation package.  |



==== Kompilátory: ====
^**Intel Fortran Composer XE 2013** ^^
|//Verze:// |13.0.1  |
|//Licence:// | |
|//Odpovědná osoba://| [[http://www.it.cas.cz/cs/pavel|Pavel Formánek]]  |
|//Odkazy:// |[[http://en.wikipedia.org/wiki/Intel_Fortran_Compiler|Wikipedia]]|
| | |
| | |
^**GCC - the GNU Compiler Collection**  ^^
|//Verze:// |4.4.4  |
|//Licence:// |GNU  |
|//Odkazy:// |[[https://gcc.gnu.org/|stránka projektu]] [[http://cs.wikipedia.org/wiki/GCC|Wikipedia]]  |




==== Knihovny: ====

^**MKL - Intel® Math Kernel Library **  ^^
|//Verze:// |117-11.0-1  |
|//Licence:// |  |
|//Odpovědná osoba://|  |
|//Odkazy:// |[[https://software.intel.com/en-us/intel-mkl|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |Knihovna je určena pro Intel Fortran Compiler.  |
| | |
| | |
^**BDDCML - Multilevel BDDC solver library **  ^^
|//Verze:// |1.3  |
|//Licence:// |GNU Lesser General Public License v3  |
|//Odpovědná osoba://|  |
|//Odkazy:// |[[http://www.math.cas.cz/~sistek/software/bddcml.html|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |The BDDCML (Balancing Domain Decomposition by Constraints - Multi-Level) is a library for solving large sparse linear systems resulting from computations by the finite element method (FEM). Domain decomposition technique is employed which allows distribution of the computations among processors.|
| | |
| | |
^**ParMETIS - Parallel Graph Partitioning and Fill-reducing Matrix Ordering **  ^^
|//Verze:// |3.2.0  |
|//Licence:// |copyrighted by the regents of the University of Minnesota  |
|//Odpovědná osoba://|  |
|//Odkazy:// |[[http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome/metis/parmetis/overview|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |ParMETIS is an MPI-based parallel library that implements a variety of algorithms for partitioning unstructured graphs, meshes, and for computing fill-reducing orderings of sparse matrices.  |

==== Systém front: ====

^**TORQUE**  ^^
|//Verze://  |  |
|//Licence:// |Open Source   |
|//Odpovědná osoba://|  |
|//Odkazy:// |[[http://www.adaptivecomputing.com/products/open-source/torque/|domovská stránka]]  |
|//Popis:// |TORQUE Resource Manager provides control over batch jobs and distributed computing resources.  |

-----

==== Změny: ====